1）源头采药，合格品提高/增加。
为确保顾客从三九药店购买的药品是合格品药，三九药店先后与拜耳、辉瑞、杜蕾斯、诺华、惠氏、强生、养生堂、同仁堂、海昌等国内外500多家知名医药健康产品厂商建立长期合作关系，直接从源头采购各类质检合格的药品、健康产品等，实现一手药源，质量提高/增加。
2）专业药师，贴心服务。
三九药店拥有一支数百人的符合资质的执业药师、医师团队，提供7*12小时的专业在线用药咨询服务。顾客可根据症状，实时在线询问药师、医师如何选药，如何服用以及必要的注意事项。真正帮助顾客选对药，治好病，省下钱。
3）优异仓储，闪电配送。
凭借不错的电商基因，三九药店具备一套强大的物流仓储管理体系，在全国范围内拥有近万平方米的自建仓库，顾客在三九药店购药可实现当天下单，当天出库的闪电配送服务。
4）货真价廉，让利顾客。
三九药店每一位顾客，三九药店出售的各类商品是符合药品质检标准的产品。合格品提高/增加，7天无理由退货，让顾客合格购药。同时，凭借源头采药和网上电商的独特资源、平台优势，三九药店竭诚让利顾客，出售的药品价格比线下实体药店多便宜近40%，同样的药品质量提高/增加，更低廉的销售价格，吸引了越来越多的患者网上购药。
三九医药股份有限公司(以下简称“本公司”)是一家在中华人民共和国注册的股份有限公司，于1999年3月2日经
原经济贸易管理委员会国经贸企改[1999]134号文件批准，由深圳三九药业有限公司(以下简称“三九药业”)、三九企业集团(深圳南方制药厂)(以下简称“三九集团”)、深圳九先生物工程有限公司(以下简称“九先生物 ”)、深圳市先达明物业管理有限公司(以下简称“先达明物业”)和惠州市壬星工贸有限公司共同发起设立，并于1999年4月21日经工商行政管理总局核准登记
于2008年5月22日，经广东省深圳市工商行政管理局核准登记，本公司换领注册号为440301103302647的企业法人营业执照。本公司所发行人民币普通股A 股股票，已在深圳证券交易所上市。
本公司注册成立时原注册资本为人民币55,300万元，股本总数55,300万股。
本公司经证券监督管理委员会以证监发行字[1999]142号文批准，于1999年11三九医药股份有限公司月面向社会公众发行人民币普通股20,000万股。
于2000年3月9日在深圳证券交易所正式上市交易，注册资本增加为75,300万元，股本总数75,300万股，其有发起人持有55,200万股，境内法人持有100万股，社会公众持有20,000万股。本公司股票面值为每股人民币1元。
根据本公司2003年度第二次股东大会决议，本公司以2002年12月31日股本75,300万股为基数，按每10股由资本公积转增3股，共计转增22,590万股(每股面值1元)，并于20 03年度实施。转增后，本公司注册资本增至人民币97,890万元，但增资的工商变更手续尚未办理完毕。
截至2008年12月31日，本公司累计发行股本总数97,890万股。
于2008 年4 月16 日，根据国资委国资产权[2008]384 号文《关于三九医药股份有限公司国有股东股权变更有关问题的批复》，三九集团所持有的本公司84,462,5 20 股国有法人股股份及三九药业所持有的本公司613,937,480 股国有法人股股份的持股主体统一变更为新三九控股有限公司(以下简称“新三九控股”)。
于2008 年6 月16 日，商务部以商资批[2008]602 号文《商务部关于同意三九医药股份有限公司股权转让的批复》同意了上述股权变更。
截至2008 年12 月31 日，除三九集团所持有的42,019, 587 股股份尚未完成变更审批及过户程序外，其余涉及转让股份已全部在证券登记结算有限责任公司深圳分公司办理过户登记确认书并过户至新三九控股。公司于2007年11月底正式进入集团。
2010年2月，经工商行政管理总局审核，并经深圳市市场监督管理局核准，公司名称由“三九医药股份有限公司”正式变更为"三九医药股份有限公司"。